
建院于1952年10月,原名为“昆明市工人医院”。1962年,更名为昆明医学院第二附属医院,2000年挂牌昆明医学院第二临床医学院,2009年和2015年分别加挂云南省泌尿专科医院、云南省肝胆胰外科医院牌子,2012年更名为昆明医科大学第二附属医院。2021年接收云光发展有限公司云光医院,将其更名为昆明医科大学第二附属医院海口医院,形成一院两区的发展模式,进一步拓展了办院空间。
建院以来,医院尊崇“明德至善”的院训,倡导家园意识和“关爱生命,情系患者,诚信友爱,和谐发展”的价值观,始终坚持“以人民健康为中心”,为戍卫人民健康,促进云南社会经济发展,维护边疆和谐稳定作出了积极贡献。“十四五”规划明确了医院建设国内知名、辐射南亚东南亚的区域高水平医院和医学人才培养中心的奋斗目标。
目前医院已经发展为科室齐全、人才济济,技术力量雄厚,学科优势突出的集医疗、教学、科研、预防、保健、突发公共卫生事件应急处理和医疗救治于一体的大型三级甲等医院。医院是卫生部首批评定的“三级甲等医院”,是“全国百佳医院”及国际紧急救援中心(SOS)网络医院,是云南省首批命名为老年友善医疗机构的医院。